MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015184	TC	4	8	175456	175463	0 %	50 %	0 %	50 %	325168474
3502	NC_015184	TGCCG	2	10	175621	175630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3503	NC_015184	GAT	2	6	175636	175641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015184	ATC	2	6	175652	175657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_015184	CGAT	2	8	175663	175670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_015184	ACC	2	6	175780	175785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_015184	CAC	3	9	175817	175825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_015184	ATT	2	6	175855	175860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015184	GAA	2	6	175932	175937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168475
3510	NC_015184	ATG	2	6	175944	175949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168475
3511	NC_015184	GAT	2	6	176041	176046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168475
3512	NC_015184	T	6	6	176134	176139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_015184	GGC	2	6	176241	176246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_015184	AAT	2	6	176253	176258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015184	CTT	2	6	176464	176469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_015184	ATG	2	6	176513	176518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015184	AATG	2	8	176702	176709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015184	TGC	2	6	176725	176730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015184	CAG	2	6	176742	176747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_015184	TTG	2	6	176786	176791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3521	NC_015184	CAT	2	6	176879	176884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
3522	NC_015184	TTC	2	6	176948	176953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168476
3523	NC_015184	TGC	2	6	177008	177013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3524	NC_015184	TTG	2	6	177026	177031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3525	NC_015184	T	6	6	177110	177115	0 %	100 %	0 %	0 %	325168476
3526	NC_015184	GCG	2	6	177116	177121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168476
3527	NC_015184	GTT	2	6	177202	177207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3528	NC_015184	GAT	2	6	177215	177220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168476
3529	NC_015184	TCA	2	6	177276	177281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
3530	NC_015184	CTG	2	6	177310	177315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3531	NC_015184	GAC	2	6	177337	177342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3532	NC_015184	TGGCA	2	10	177390	177399	20 %	20 %	40 %	20 %	325168476
3533	NC_015184	GTT	2	6	177400	177405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3534	NC_015184	ATC	2	6	177426	177431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
3535	NC_015184	AC	3	6	177453	177458	50 %	0 %	0 %	50 %	325168476
3536	NC_015184	GGA	2	6	177467	177472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015184	ATC	2	6	177515	177520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3538	NC_015184	TCA	2	6	177522	177527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3539	NC_015184	TCG	2	6	177537	177542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3540	NC_015184	GGA	2	6	177569	177574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168477
3541	NC_015184	TGGC	2	8	177609	177616	0 %	25 %	50 %	25 %	325168477
3542	NC_015184	TGA	2	6	177647	177652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168477
3543	NC_015184	CTT	2	6	177708	177713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168477
3544	NC_015184	GGA	2	6	177788	177793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168477
3545	NC_015184	CGCTGT	2	12	177836	177847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3546	NC_015184	CAT	2	6	177870	177875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3547	NC_015184	ATG	2	6	177904	177909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168477
3548	NC_015184	TGGG	2	8	177945	177952	0 %	25 %	75 %	0 %	325168477
3549	NC_015184	CAA	2	6	177967	177972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168477
3550	NC_015184	ACG	2	6	178008	178013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3551	NC_015184	TGG	2	6	178015	178020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168477
3552	NC_015184	CGG	2	6	178202	178207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168478
3553	NC_015184	AAC	2	6	178246	178251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168478
3554	NC_015184	ATA	2	6	178261	178266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168478
3555	NC_015184	ATC	2	6	178320	178325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168478
3556	NC_015184	GGA	2	6	178341	178346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168478
3557	NC_015184	T	7	7	178385	178391	0 %	100 %	0 %	0 %	325168478
3558	NC_015184	AAAG	2	8	178447	178454	75 %	0 %	25 %	0 %	325168478
3559	NC_015184	CCGC	2	8	178526	178533	0 %	0 %	25 %	75 %	325168478
3560	NC_015184	ACC	2	6	178553	178558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168478
3561	NC_015184	TTC	2	6	178561	178566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168478
3562	NC_015184	ACC	2	6	178607	178612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168478
3563	NC_015184	GGC	2	6	178649	178654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168478
3564	NC_015184	GCT	2	6	178712	178717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168478
3565	NC_015184	ATA	2	6	178964	178969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015184	CTT	2	6	179039	179044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168479
3567	NC_015184	TCT	2	6	179075	179080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168479
3568	NC_015184	GCA	2	6	179157	179162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168479
3569	NC_015184	CG	3	6	179293	179298	0 %	0 %	50 %	50 %	325168479
3570	NC_015184	TC	3	6	179381	179386	0 %	50 %	0 %	50 %	325168479
3571	NC_015184	TGA	2	6	179413	179418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168479
3572	NC_015184	GAA	2	6	179497	179502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015184	GC	3	6	179601	179606	0 %	0 %	50 %	50 %	325168480
3574	NC_015184	GCC	2	6	179757	179762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168480
3575	NC_015184	CCT	2	6	179842	179847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168480
3576	NC_015184	GTT	2	6	179859	179864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168480
3577	NC_015184	TGA	2	6	179902	179907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_015184	GCT	2	6	179976	179981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_015184	A	6	6	180082	180087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015184	ACC	2	6	180131	180136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_015184	AG	3	6	180162	180167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_015184	AAC	2	6	180209	180214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168481
3583	NC_015184	GGGA	2	8	180232	180239	25 %	0 %	75 %	0 %	325168481
3584	NC_015184	ACGA	2	8	180383	180390	50 %	0 %	25 %	25 %	325168482
3585	NC_015184	ACA	2	6	180393	180398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168482
3586	NC_015184	AGA	2	6	180409	180414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168482
3587	NC_015184	AAC	2	6	180461	180466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168482
3588	NC_015184	AAT	2	6	180467	180472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168482
3589	NC_015184	TCA	2	6	180498	180503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168482
3590	NC_015184	GAC	2	6	180512	180517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168482
3591	NC_015184	AAG	2	6	180557	180562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168482
3592	NC_015184	ACG	2	6	180579	180584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168482
3593	NC_015184	ACGA	2	8	180593	180600	50 %	0 %	25 %	25 %	325168482
3594	NC_015184	TAA	2	6	180663	180668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015184	ACG	2	6	180707	180712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015184	ACG	2	6	180762	180767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168483
3597	NC_015184	CGC	2	6	180870	180875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168483
3598	NC_015184	CGC	2	6	180913	180918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168483
3599	NC_015184	ATG	2	6	180941	180946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168483
3600	NC_015184	TTC	2	6	180963	180968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168483
3601	NC_015184	TCTT	2	8	181000	181007	0 %	75 %	0 %	25 %	325168483
3602	NC_015184	TGG	2	6	181010	181015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168483
3603	NC_015184	ACA	2	6	181025	181030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168483
3604	NC_015184	GCA	2	6	181040	181045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168483
3605	NC_015184	TGT	2	6	181047	181052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168483
3606	NC_015184	TTG	2	6	181056	181061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168483
3607	NC_015184	ATC	2	6	181116	181121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168484
3608	NC_015184	ATA	2	6	181195	181200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168484
3609	NC_015184	GCG	2	6	181209	181214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168484
3610	NC_015184	GAT	2	6	181353	181358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168484
3611	NC_015184	GGC	2	6	181380	181385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168484
3612	NC_015184	CCG	2	6	181430	181435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168484
3613	NC_015184	TGT	2	6	181444	181449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168484
3614	NC_015184	CTG	2	6	181450	181455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168484
3615	NC_015184	ACG	2	6	181459	181464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168484
3616	NC_015184	CTC	2	6	181482	181487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168484
3617	NC_015184	TCGG	2	8	181530	181537	0 %	25 %	50 %	25 %	325168484
3618	NC_015184	CTG	2	6	181618	181623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168484
3619	NC_015184	TGC	2	6	181889	181894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168484
3620	NC_015184	TGC	2	6	182042	182047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_015184	CTG	2	6	182048	182053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_015184	ATGT	2	8	182071	182078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015184	GCC	3	9	182079	182087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3754	NC_015184	ACTG	2	8	188437	188444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3758	NC_015184	ATCC	2	8	188597	188604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3775	NC_015184	AGG	2	6	189871	189876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3990	NC_015184	GCC	2	6	201045	201050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168505
3991	NC_015184	GAG	2	6	201058	201063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168505
3992	NC_015184	GGC	2	6	201080	201085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168505
3993	NC_015184	CGC	2	6	201128	201133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168505
3994	NC_015184	TGG	2	6	201160	201165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168505
3995	NC_015184	GC	3	6	201219	201224	0 %	0 %	50 %	50 %	325168505
3996	NC_015184	CGG	2	6	201232	201237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168505
3997	NC_015184	GAT	2	6	201335	201340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168506
3998	NC_015184	TCCG	2	8	201365	201372	0 %	25 %	25 %	50 %	325168506
3999	NC_015184	GCT	2	6	201449	201454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168506
4000	NC_015184	GCAA	2	8	201552	201559	50 %	0 %	25 %	25 %	325168506

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